Du kan bruge -m mulighed for at angive en fil, der indeholder en kommando, der skal køres på fjernforbindelsen.
Eksempel:
C:\Progra~1\Putty\putty.exe -ssh -m C:\cmd.txt example@sqldat.com
Indhold af C:\cmd.txt
mysql -u USER -pPASS db < /tmp/dump.sql
Fra Putty-dokumentationen :