PHP PDO multiple select-forespørgsel, der konsekvent dropper sidste rækkesæt

Jeg tror, ​​du er over at komplicere tingene med din do/while loop.

Prøv en simpel while-løkke i stedet:

$pdo = /* connection stuff here */
$sql = "select 1; select 2; select 3; select 4;";
$statement = $pdo->query($sql);

while($rowset = $statement->fetchAll()){
    //do stuff

    $statement->nextRowset();
}

Dette vil fortsætte med at sløjfe, mens rækkesættet ikke har en falsk værdi, som så skulle fungere nøjagtigt, som du forventer.