Brug af gnu awk (på grund af RS)
awk '{$1=$1} NR%2==1 {printf "%s,",$0} NR%2==0' RS="[,\n]" file
XXXXXXXXXX,YYYYYYYYYY
TTTTTTTTTTT,UUUUUUUUUU
RRRRRRRRR,JJJJJJJJJ
111111111111,22222222222
333333333333,44444444
5555555,666666
EEEEEEEE,WWWWWW
QQQQQQQ,PPPPPPPP
{$1=$1} Rydder op og fjerner ekstra mellemrumNR%2==1 {printf "%s,",$0} udskriver ulige deleNR%2==0 udskriver lige dele og ny linjeRS="[,\n]" indstiller posten til , eller ny linje