Brug af gnu awk
(på grund af RS)
awk '{$1=$1} NR%2==1 {printf "%s,",$0} NR%2==0' RS="[,\n]" file
XXXXXXXXXX,YYYYYYYYYY
TTTTTTTTTTT,UUUUUUUUUU
RRRRRRRRR,JJJJJJJJJ
111111111111,22222222222
333333333333,44444444
5555555,666666
EEEEEEEE,WWWWWW
QQQQQQQ,PPPPPPPP
{$1=$1}
Rydder op og fjerner ekstra mellemrumNR%2==1 {printf "%s,",$0}
udskriver ulige deleNR%2==0
udskriver lige dele og ny linjeRS="[,\n]"
indstiller posten til ,
eller ny linje