I mit tilfælde oprettede jeg manuelt sql-migreringsscript. Dette virker dog muligvis ikke, hvis du beslutter dig for at bruge en anden db.
operations = [
migrations.RenameModel(
old_name='Permission',
new_name='TemplatePermission',
),
migrations.RunSQL('alter sequence myapp_permission_id_seq rename to myapp_templatepermission_id_seq;'),
]